О
Я биоинформатик, специализирующийся на геномных технологиях, секвенировании нанопор в реальном времени, анализе сигналов, машинном обучении и соответствующем оборудовании. У меня есть опыт разработки программного обеспечения и более десяти лет опыта работы в отрасли патологии.
Ведя вычислительные разработки в группе геномных технологий Центра популяционной геномики в Гарванском институте медицинских исследований, я применяю свои уникальные навыки для разработки новых биоинформационных инструментов, а также для проектирования и поддержки инфраструктуры секвенирования нанопор.
Мои области исследований включают в себя:
-
Анализ сигнала нанопор
-
Клинические испытания и разработка методов
-
Нарушения с короткими тандемными повторами
-
Вирусная геномика (ВИЧ/SARS-Cov-2)
-
Одноклеточное секвенирование
-
Прямое секвенирование РНК
-
Сборка генома
-
Обнаружение метилирования
-
Машинное/глубокое обучение

Опыт
Институт Гарвана / Аналитик геномных систем
Июнь 2017 – НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ, Darlinghurst
Cerebro Biosystems / Соучредитель и технический директор
Октябрь 2017 г. - НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ, Darlinghurst
Healius (Первичное здравоохранение) / Старший Разработчик программного обеспечения
Декабрь 2017 г. - НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ, Сент-Леонардс
Институт Гарвана / Стажер-исследователь
декабрь 2016 г. – июнь 2017 г., Дарлингхерст
Первичное здравоохранение / Программист-аналитик
Июнь 2015 г. - июнь 2017 г., Сент-Леонардс
Дуглас Хэнли Мойр Патология / Лаборант
2011–2015, Маккуори Парк
Дэвис Кэмпбелл Де Ламберт/Healthscope Pathology/лаборант
2009-2011, Райд
Награды
-
2020 - Приз плаката, занявший второе место - London Calling
-
2019 - Премия Lighting Talk - ABACBS/GIW
-
2018 - Премия Палмера за инновации - Премия Гарвана
-
2017 - Премия J&J - Med Tech's Got Talent
-
2017 - Премия Гарвана: за достижение «выше и дальше» в поддержке культуры биоинформатики в Гарване.
-
2017 - Награда за последний плакат - Конференция AGTA
Навыки и умения
-
Linux/UNIX, BASH
-
Python, статистическое программирование R, C, AHK, SQL
-
разработка алгоритма
-
Высокопроизводительные вычисления (SGE)
-
Биоинформатика, наука о данных
-
системное администрирование, автоматизация, сеть,\
-
Лабораторные информационные системы (ЛИС)