top of page

О

Я биоинформатик, специализирующийся на геномных технологиях, секвенировании нанопор в реальном времени, анализе сигналов, машинном обучении и соответствующем оборудовании. У меня есть опыт разработки программного обеспечения и более десяти лет опыта работы в отрасли патологии.
 

Ведя вычислительные разработки в группе геномных технологий Центра популяционной геномики в Гарванском институте медицинских исследований, я применяю свои уникальные навыки для разработки новых биоинформационных инструментов, а также для проектирования и поддержки инфраструктуры секвенирования нанопор.

Мои области исследований включают в себя:

  • Анализ сигнала нанопор

  • Клинические испытания и разработка методов

  • Нарушения с короткими тандемными повторами

  • Вирусная геномика (ВИЧ/SARS-Cov-2)

  • Одноклеточное секвенирование

  • Прямое секвенирование РНК

  • Сборка генома

  • Обнаружение метилирования

  • Машинное/глубокое обучение

4Gf_tFdh_400x400.jpg

Опыт

Институт Гарвана / Аналитик геномных систем

Июнь 2017 – НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ,  Darlinghurst

Cerebro Biosystems / Соучредитель и технический директор

Октябрь 2017 г. - НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ,  Darlinghurst

Healius (Первичное здравоохранение) / Старший Разработчик программного обеспечения 

Декабрь 2017 г. - НАСТОЯЩЕЕ ВРЕМЯ,  Сент-Леонардс

Институт Гарвана / Стажер-исследователь

декабрь 2016 г. – июнь 2017 г.,   Дарлингхерст

Первичное здравоохранение / Программист-аналитик

Июнь 2015 г. - июнь 2017 г.,  Сент-Леонардс

Дуглас Хэнли Мойр Патология / Лаборант

2011–2015,  Маккуори Парк

Дэвис Кэмпбелл Де Ламберт/Healthscope Pathology/лаборант

2009-2011,  Райд

Награды

  • 2020 - Приз плаката, занявший второе место - London Calling

  • 2019 - Премия Lighting Talk - ABACBS/GIW

  • 2018 - Премия Палмера за инновации - Премия Гарвана

  • 2017 - Премия J&J - Med Tech's Got Talent

  • 2017 - Премия Гарвана: за достижение «выше и дальше» в поддержке культуры биоинформатики в Гарване.

  • 2017 - Награда за последний плакат - Конференция AGTA

Навыки и умения

  • Linux/UNIX, BASH

  • Python, статистическое программирование R, C, AHK, SQL

  • разработка алгоритма

  • Высокопроизводительные вычисления (SGE)

  • Биоинформатика, наука о данных

  • системное администрирование, автоматизация, сеть,\

  • Лабораторные информационные системы (ЛИС)

Контакт
Информация

Группа геномных технологий
Центр популяционной геномики

Институт медицинских исследований Гарвана

  • github
  • LinkedIn
  • Twitter
  • mastodon

Спасибо за отправку!

© 2022 Джеймс М. Фергюсон. Создано сWix.com

bottom of page